Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms