Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf38aQ4FK66 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms