Protein–RNA interactions for Protein: Q3UST5

UPF0764 protein C16orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UST5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3UST5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3UST5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3UST5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3UST5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3UST5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3UST5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3UST5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3UST5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3UST5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3UST5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3UST5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3UST5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3UST5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3UST5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3UST5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3UST5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3UST5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3UST5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3UST5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3UST5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3UST5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3UST5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3UST5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3UST5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3UST5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3UST5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3UST5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UST5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UST5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UST5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UST5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UST5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UST5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UST5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UST5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UST5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UST5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3UST5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UST5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UST5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UST5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UST5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UST5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UST5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UST5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UST5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3UST5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UST5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UST5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UST5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UST5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UST5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UST5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UST5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UST5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UST5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UST5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3UST5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UST5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UST5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UST5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UST5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UST5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UST5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UST5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UST5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3UST5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3UST5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3UST5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3UST5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3UST5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3UST5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3UST5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3UST5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3UST5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3UST5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3UST5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3UST5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3UST5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3UST5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3UST5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3UST5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3UST5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3UST5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3UST5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3UST5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3UST5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3UST5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3UST5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3UST5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3UST5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3UST5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3UST5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3UST5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3UST5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3UST5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3UST5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3UST5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3UST5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms