Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms