Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms