Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf6Q3TWW8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms