Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CiartQ3TQ03 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CiartQ3TQ03 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CiartQ3TQ03 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CiartQ3TQ03 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms