Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc10Q3TLI0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms