Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Fgfbp3Q1HCM0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Fgfbp3Q1HCM0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Fgfbp3Q1HCM0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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