Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc138Q0VF22 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms