Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MitfQ08874 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MitfQ08874 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MitfQ08874 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MitfQ08874 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 515.8 ms