Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms