Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms