Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Yy1Q00899 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms