Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Xrn1P97789 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Xrn1P97789 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Xrn1P97789 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Xrn1P97789 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Xrn1P97789 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Xrn1P97789 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Xrn1P97789 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Xrn1P97789 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Xrn1P97789 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Xrn1P97789 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Xrn1P97789 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Xrn1P97789 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Xrn1P97789 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms