Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bop1P97452 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bop1P97452 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bop1P97452 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bop1P97452 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bop1P97452 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bop1P97452 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bop1P97452 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bop1P97452 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bop1P97452 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Bop1P97452 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bop1P97452 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bop1P97452 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms