Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upp1P52624 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Upp1P52624 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upp1P52624 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Upp1P52624 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upp1P52624 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upp1P52624 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Upp1P52624 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upp1P52624 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upp1P52624 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upp1P52624 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upp1P52624 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upp1P52624 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upp1P52624 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms