Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox2P48432 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox2P48432 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox2P48432 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox2P48432 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox2P48432 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox2P48432 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox2P48432 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms