Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CratP47934 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CratP47934 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CratP47934 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CratP47934 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CratP47934 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CratP47934 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CratP47934 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CratP47934 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CratP47934 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CratP47934 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CratP47934 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CratP47934 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CratP47934 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CratP47934 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CratP47934 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CratP47934 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CratP47934 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CratP47934 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CratP47934 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CratP47934 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CratP47934 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CratP47934 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CratP47934 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CratP47934 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CratP47934 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CratP47934 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CratP47934 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CratP47934 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CratP47934 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CratP47934 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CratP47934 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CratP47934 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CratP47934 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CratP47934 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CratP47934 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CratP47934 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CratP47934 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CratP47934 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CratP47934 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CratP47934 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CratP47934 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CratP47934 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CratP47934 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CratP47934 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CratP47934 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CratP47934 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CratP47934 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CratP47934 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CratP47934 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CratP47934 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CratP47934 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CratP47934 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CratP47934 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CratP47934 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CratP47934 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CratP47934 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CratP47934 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CratP47934 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CratP47934 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CratP47934 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CratP47934 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CratP47934 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CratP47934 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CratP47934 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CratP47934 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CratP47934 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CratP47934 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CratP47934 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CratP47934 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CratP47934 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CratP47934 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CratP47934 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CratP47934 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CratP47934 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CratP47934 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CratP47934 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CratP47934 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CratP47934 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CratP47934 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CratP47934 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CratP47934 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CratP47934 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CratP47934 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CratP47934 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CratP47934 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CratP47934 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CratP47934 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CratP47934 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CratP47934 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CratP47934 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CratP47934 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CratP47934 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CratP47934 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CratP47934 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CratP47934 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CratP47934 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CratP47934 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CratP47934 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CratP47934 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms