Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nedd4P46935 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms