Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms