Protein–RNA interactions for Protein: P41272

Cd27, CD27 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd27P41272 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd27P41272 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd27P41272 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd27P41272 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd27P41272 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd27P41272 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd27P41272 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd27P41272 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd27P41272 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd27P41272 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd27P41272 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd27P41272 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd27P41272 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd27P41272 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd27P41272 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd27P41272 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd27P41272 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd27P41272 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd27P41272 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd27P41272 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd27P41272 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd27P41272 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd27P41272 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd27P41272 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd27P41272 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd27P41272 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd27P41272 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd27P41272 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd27P41272 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms