Protein–RNA interactions for Protein: P31315

Gsx1, GS homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx1P31315 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gsx1P31315 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms