Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms