Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnd2P30280 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd2P30280 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd2P30280 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms