Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrm1P12657 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrm1P12657 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrm1P12657 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms