Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FlgP11088 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FlgP11088 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FlgP11088 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FlgP11088 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FlgP11088 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FlgP11088 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FlgP11088 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FlgP11088 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FlgP11088 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FlgP11088 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FlgP11088 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FlgP11088 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FlgP11088 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FlgP11088 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FlgP11088 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FlgP11088 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FlgP11088 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FlgP11088 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FlgP11088 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FlgP11088 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FlgP11088 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FlgP11088 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FlgP11088 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FlgP11088 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FlgP11088 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FlgP11088 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FlgP11088 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FlgP11088 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FlgP11088 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FlgP11088 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FlgP11088 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FlgP11088 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FlgP11088 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FlgP11088 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FlgP11088 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FlgP11088 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FlgP11088 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FlgP11088 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FlgP11088 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FlgP11088 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FlgP11088 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FlgP11088 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FlgP11088 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FlgP11088 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FlgP11088 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FlgP11088 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FlgP11088 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FlgP11088 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FlgP11088 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FlgP11088 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FlgP11088 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FlgP11088 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FlgP11088 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FlgP11088 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FlgP11088 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FlgP11088 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FlgP11088 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FlgP11088 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FlgP11088 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FlgP11088 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FlgP11088 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FlgP11088 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FlgP11088 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FlgP11088 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FlgP11088 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FlgP11088 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FlgP11088 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FlgP11088 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FlgP11088 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FlgP11088 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FlgP11088 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FlgP11088 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
FlgP11088 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FlgP11088 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FlgP11088 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FlgP11088 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FlgP11088 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FlgP11088 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FlgP11088 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FlgP11088 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FlgP11088 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FlgP11088 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FlgP11088 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FlgP11088 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FlgP11088 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FlgP11088 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FlgP11088 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FlgP11088 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FlgP11088 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FlgP11088 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FlgP11088 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FlgP11088 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FlgP11088 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FlgP11088 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FlgP11088 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FlgP11088 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FlgP11088 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FlgP11088 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FlgP11088 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms