Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prf1P10820 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Prf1P10820 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prf1P10820 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prf1P10820 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms