Protein–RNA interactions for Protein: P01802

Ig heavy chain V-III region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01802 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01802 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01802 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01802 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01802 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01802 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01802 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01802 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01802 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01802 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01802 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01802 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01802 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01802 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01802 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01802 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01802 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01802 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01802 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01802 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01802 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01802 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01802 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01802 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01802 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01802 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01802 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01802 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01802 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01802 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01802 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01802 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01802 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01802 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01802 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01802 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01802 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01802 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01802 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01802 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01802 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01802 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01802 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01802 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01802 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01802 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01802 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01802 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01802 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01802 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01802 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01802 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01802 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01802 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01802 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01802 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01802 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01802 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01802 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01802 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01802 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01802 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01802 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01802 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01802 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01802 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01802 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01802 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01802 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01802 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01802 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01802 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01802 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01802 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01802 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01802 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01802 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01802 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01802 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01802 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01802 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01802 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01802 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01802 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01802 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01802 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01802 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01802 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01802 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01802 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01802 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01802 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01802 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01802 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01802 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01802 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01802 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01802 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01802 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01802 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms