Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BckdkO55028 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BckdkO55028 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BckdkO55028 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BckdkO55028 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BckdkO55028 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BckdkO55028 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BckdkO55028 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BckdkO55028 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BckdkO55028 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms