Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chil3O35744 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chil3O35744 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chil3O35744 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chil3O35744 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chil3O35744 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chil3O35744 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chil3O35744 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms