Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rabep1O35551 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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