Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.7 ms