Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna3O08545 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna3O08545 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna3O08545 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna3O08545 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna3O08545 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna3O08545 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Efna3O08545 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna3O08545 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna3O08545 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna3O08545 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna3O08545 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna3O08545 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms