Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm21976J3QNN2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Gm21976J3QNN2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Gm21976J3QNN2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Gm21976J3QNN2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Gm21976J3QNN2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Gm21976J3QNN2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21976J3QNN2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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