Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8247F6VRJ8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8247F6VRJ8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms