Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms