Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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