Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms