Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms