Protein–RNA interactions for Protein: A2AVA0

Svep1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1A2AVA0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms