Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ankrd60A2AMD2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd60A2AMD2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd60A2AMD2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd60A2AMD2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd60A2AMD2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd60A2AMD2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd60A2AMD2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd60A2AMD2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd60A2AMD2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd60A2AMD2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd60A2AMD2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd60A2AMD2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd60A2AMD2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd60A2AMD2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd60A2AMD2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd60A2AMD2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd60A2AMD2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd60A2AMD2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd60A2AMD2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms