Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt71Q9R0H5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms