Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plod3Q9R0E1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms