Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsfQ9R013 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms