Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Six6Q9QZ28 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.9 ms