Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bcl11aQ9QYE3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms