Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms