Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cml5Q9QXS8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cml5Q9QXS8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.5 ms