Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.5 ms